벼 형질전환체 유전자 발현 비교분석을 통한 ABP 57 유전자의 기능 분석

• 영문명: Functional Analysis of ABP 57 Gene by Microarray in Transgenic Rice Plants
• 발행기관: 한국육종학회
• 저자명: 장안철(Ancheol Chang) 최지영(Ji-Young Choi) 박순기(Soon Ki Park) 배신철(Shin-Chul Bae) 김동헌(Dong-Hern Kim)
• 간행물 정보: 『한국육종학회지』Vol.44 No.4, 538~546쪽, 전체 9쪽
• 주제분류: 농수해양 > 기타농수해양
• 파일형태: PDF
• 발행일자: 2012.12.30

국문 초록

본 연구는 벼에서 양성자 펌프의 활성을 증가시키는 것으로 알려진 오옥실 결합단백질 ABP57 유전자의 과발현에 따른 분자생물학적 특성을 분석해 작물 분자육종을 위한 기초자료로 활용하고자 수행하였다. ABP57 유전자 과발현 형질전환체와 대비 품종 낙동벼의 뿌리조직에서 유전자 발현 변화를 비교 분석한 결과는 다음과 같다. 두 식물체간에 발현량이 2배 이상 차이를 보인 유전자수는 29,389개 중 총 148개였으며, 그 가운데 65개는 발현량 증가를 보였다. ABP57 유전자 과발현 형질전환체에서 발현량 변화를 보인 유전자들의 생물적 기능을 분석하기 위해 유전자 온톨로지 분석을 수행한 결과 각 부문별로 생물적 작용 부문에 67개 세부항, 세포 구성요소 부문에 59개 세부항, 분자기능 부문에 29개 세부항에 각각 영향을 미치는 것으로 나타났다. ABP57 유전자 과발현에 따라 세 개 부문 모두에서 공통적으로 나타난 영향은 H+ -ATPases의 활성 증가, 여기에 필요한 에너지원 관련 화합물(ATPs, purines) 생합성 및 대사관련 활동 증가, 이온의 막투과 및 운반체 활동 증가 등이 확인되어 Kim et al.(2001)의 선행 연구결과와 일치하는 경향이었다. 그러나, 엽록체의 일부 구성요소나 G-protein 결합 단백질 신호전달경로, cytokine 신호전달 경로 등과 관련된 단백질 활성 감소는 식물 생육에 부정적 영향을 미칠 것으로 추정된다. 따라서, 향후 작물의 효율적 분자육종을 위해서는 개별 유전자의 명확한 기능 분석과 더불어 유전자 상호작용에 대한 네트워크 분석 등에 대한 연구개발 노력과 함께 형질전환 식물체에 대한 생리적 특성, 표현형, 농업형질 특성 등에 대한 효과적 분석을 위해 전통육종과의 지속적 교류와 협력이 반드시 필요할 것이다.

영문 초록

An auxin-binding protein(ABP57) was previously isolated from rice and known to activate plasmamembrane H+-ATPasesvia direct interaction. In this study we analyzed gene expression profiles of ABP57 gene overexpressed transgenic rice plants bymicroarray analysis to understand its biological and molecular function. A total of 148 cDNAs out of 29,389 unique genesshowed changes more than 2 folds in ABP57 gene overexpressed root tissues. From the gene ontology analyses of the expressionprofiles, patterns of gene expression were observed in three categories as follows: (1) in biological process, genes involved intransmembrane ion transport, hydrogen and cation transport, and generation of precursor metabolites and energy were highlyup-regulated; (2) in cellular component, genes involved in mitochondrial part were highly up-regulated, whereas those ofchloroplast part were down-regulated; (3) in molecular function, genes involved in hydrogen and ion transmembrane transporteractivity and their ATP synthase activity were highly up-regulated. The results supported that the overexpression of ABP57 couldhighly activate plasmamembrane H+-ATPases. The challenges for future studies are to characterize the functional and physiologicalroles of the ABP57 responsive genes including the large numbers of genes of unknown functions.

목차

서 언

재료 및 방법

결과 및 고찰

적 요

키워드

ABP57 H+-ATPase Transmembrane Ion Transport