Simple Sequence Repeat 마커를 이용한 감 수집계통 및 품종의 유연관계분석

• 영문명: Evaluation of Genetic Diversity Among Persimmon (Diospyros kaki Thunb.) Collection Lines and Cultivars Using Simple Sequence Repeat Markers
• 발행기관: 한국육종학회
• 저자명: 박여옥(Yeo-Ok Park) 박두상(Doo-Sang Park) 손지영(Ji-Young Son) 최성태(Seong-Tae Choi) 김성철(Sung-Chul Kim) 홍광표(Gwang-Pyo Hong) 박영훈(Young-Hoon Park)
• 간행물 정보: 『한국육종학회지』Vol.44 No.2, 127~135쪽, 전체 9쪽
• 주제분류: 농수해양 > 기타농수해양
• 파일형태: PDF
• 발행일자: 2012.06.30

국문 초록

총 22개의 감 SSR primer set을 사용하여 주요 재배품종 17품종, 수집한 단감 변이개체 13종 등, 총 30개의 유전적 연관성을 분석하였다. 획득한 469개의 다형성 밴드를 이용하여 UPGMA 방식으로 유사도 및 집괴분석을 수행한 결과, 30개의 품종 및 수집 계통들은 크게 2개의 그룹(cluster)으로 나뉘어졌으며, 제 1 cluster는 다시 3개의 subcluster로, 제 2 cluster 는 다시 2개의 subcluster를 형성하였다. 이는 수집 계통들이 기존 대조품종들과 서로 동일군으로 분포되고 있어 형태적으로 유사할 수 있고 근연되어 있지만, 유전자적 수준에서는 다른 조성을 가지고 있음을 보여준다. 평균 유사도의 값은 0.164이였고 품종간 가장 높은 유사도 값(0.31)을 나타낸 것은 ‘차랑’과 ‘전천차랑’이였고, 가장 낮은 유사도 값(0.02)를 나타낸 것은 Ⅱ 그룹과 비교하여 Ⅰ 그룹에 속하는 ‘Rojo Brillante’ 였다. 본 연구에 사용된 22 SSR primer set을 통해, ‘차랑’과 ‘전천차랑’을 제외한 대조품종과 수집 계통간의 구별이 가능 하여 향후 신품종 개발시 품종보호를 위한 특이적 마커로 효율적으로 사용될 수 있을 것으로 판단된다.

영문 초록

Genetic diversity among 30 accessions of persimmon (Diospyros kaki Thunb.) collection lines and cultivars was evaluated by using simple sequence repeat (SSR) markers. From 22 SSR primer sets, a total of 469 polymorphic markers were detected among 17 cultivars and 13 collection lines. Analysis of pair-wise genetic similarity coefficient (Nei-Li) and unweighed pair-group method with arithmetic averaging (UPGMA) clustering revealed two main clusters including three subclusters for clusterⅠ and two subclusters for clusterⅡ. The collection lines were classified into the same group with their check cultivars that showed similarities in phenotypic characteristics. However, these collection lines were clearly discriminated from check cultivars by marker genotypes. Genetic similarity co-efficiency was 0.164 in average and the highest (0.31) similarity was observed between ‘Jiro’ and ‘Maegawajiro’. The lowest similarity (0.02) was observed from ‘Rojo Brillante’ of clusterⅠin comparison to clusterⅡ. Except for ‘Jiro’ and ‘Maegawajiro’, it was possible to identify each cultivar and collection line based on the SSR fingerprints, suggesting that SSR markers can be useful for protecting intellectual property on newly developed cultivars.

목차

서 언

재료 및 방법

결과 및 고찰

적 요

인 용 문 헌

키워드

Persimmon Collection line Cultivar identification Simple sequence repeats