학술논문
복숭아 NGS 분석에 의한 다형성 SSR 마커 개발과 활용
이용수 10
- 영문명
- Anticipated Polymorphic SSRs and Their Application Based on Next Generation Sequencing of Prunus Persica
- 발행기관
- 한국육종학회
- 저자명
- 김정선(Jung Sun Kim) 구윤숙(Yoon Suk Ku) 박신기(Sin-Gi Park) 김세희(Se Hee Kim) 박현우(Hyun Woo Park) 원소윤(So Youn Won)
- 간행물 정보
- 『한국육종학회지』Vol.53 No.4, 350~372쪽, 전체 23쪽
- 주제분류
- 농수해양 > 기타농수해양
- 파일형태
- 발행일자
- 2021.12.01
5,560원
구매일시로부터 72시간 이내에 다운로드 가능합니다.
이 학술논문 정보는 (주)교보문고와 각 발행기관 사이에 저작물 이용 계약이 체결된 것으로, 교보문고를 통해 제공되고 있습니다.
국문 초록
영문 초록
Prunus persica “Mihong” cultivar is a domesticated white peach that was generated from the crossing between “Yumyeong” and“Chiyomaru” cultivars in the Republic of Korea in 1995. We launched “Mihong” genome sequencing in 2018 and “Mihong” reached to 200scaffold and 241 Mb sequences using long-read sequencing and Hi-C technology. F1 populations of ”Kawanakajima Hakuto,” “Mihong,”“Changhowon Hwangdo,” and “Yumi” were developed in NIHHS. These four cultivars were sequenced and assembled using the SOAPdenovoversion 2.04. First, we surveyed the SSRs in “Mihong” assembly sequences and extracted the ±300 bp flanking sequences containing SSRs. Second, the assembly sequences of three cultivars were aligned and mapped against “Mihong” ±300 bp flanking sequences using BLASTn(version 2.2.29+). We anticipated the differential length in SSRs among the four cultivars. We sorted the primers with a standard deviationover 4.5 (STEV > 4.5) among the four cultivars. In addition, we surveyed the primers having difference in over 10 bp with “KawanakajimaHakuto” and “Mihong” for polymorphic markers in the mapping population. All primer pairs were designed to generate amplicons of 150-200bp in coating SSR regions using primer3 (version 3-2.2.3). We selected 260 SSR markers with a physical distance of average per 1 Mb. These SSR markers accounted for 74% polymorphism in the four genotypes. Finally, a F1 population of “Kawanakajima Hakuto” and “Mihong”covered 884.5 cM with 465 SNPs and 86 SSRs and this genetic map matched correctly to the HI-C pseudomolecule of P. persica.
목차
서언
재료 및 방법
결과 및 고찰
적요
사사
보충자료
해당간행물 수록 논문
- 한국육종학회지 Vol.53 No.4 목차
- Korean Journal of Breeding Science
- 저항성 유전자 도입과 벼 후대계통의 열악형질간의 관계분석
- 조생종 고품질 완전단감 ‘원추’ 육성
- 안토시아닌 고함유 자색옥수수 ‘색소1호’의 주요특성
- 보리호위축병과 도복에 강한 맥주보리 ‘누리맥’
- 한국 재래종 벼 유묘기 뿌리 발달 전장유전체연관분석
- 작물 표현체 플랫폼 기반 벼 이미지 분석 조건 확립
- 다양한 비생물적 스트레스에 의해 유도되는 RsMYB1 프로모터의 특성분석
- 멜론 덩굴쪼김병균(Fusarium oxysporum f. sp. melonis) race 2에 대한 멜론 유전자원 저항성 평가
- 배 ‘만풍배’와 ‘대원홍’ 종간 교배 후대에서 주요 과실 형질 유전 분석
- 고온피해와 도복에 강하여 재배 안전성이 높은 인삼 품종 ‘선명’
- 내건 내서성 감자 ‘아리랑 2호’
- 담적색 종피색의 내도복 신품종 팥 ‘홍경’ 육성
- 유전자교정 기반 신육종기술의 글로벌 특허동향
- Waxy 유전자 좌위 분자마커를 이용한 아밀로스 함량별 벼 품종 분류
- 한국잔디 ‘한라그린 10’ 품종의 개발
- 복숭아 NGS 분석에 의한 다형성 SSR 마커 개발과 활용
- 다분지 고올레산 다수성 땅콩 신품종 ‘해올’
- 저온에서 녹기연장의 한국잔디 ‘한라그린 7’ 품종 개발
- 한국 재래종 콩 유전자원의 이소플라본 함량과 수량관련형질에 대한 연차간 비교
- 수출용 대과성 딸기 품종 ‘알타킹’
- 휴면기간이 짧고 숙기가 빠른 2기작 감자 신품종 ‘새봉’
- Fluidigm 시스템을 이용한 고추 유전자원의 주요병 유전형 평가
- Korean Journal of Breeding Science: 2021 Editorial Board
- 중만생 복합내병 다수성 발아현미용 거대배아미 ‘큰품’
참고문헌
교보eBook 첫 방문을 환영 합니다!
신규가입 혜택 지급이 완료 되었습니다.
바로 사용 가능한 교보e캐시 1,000원 (유효기간 7일)
지금 바로 교보eBook의 다양한 콘텐츠를 이용해 보세요!