SSR 마커를 이용한 차나무 품종의 판별

• 영문명: Identification of Tea Plant Cultivars Using SSR Markers
• 발행기관: 한국차학회
• 저자명: 김주영(Ju Young Kim) 오은의(Eun Ui Oh) 이소진(So Jin Lee) 문두경(Doo Gyung Moon) 김호방(Ho Bang Kim) 송관정(Kwan Jung Song)
• 간행물 정보: 『한국차학회지』제26권 제4호, 48~64쪽, 전체 17쪽
• 주제분류: 농수해양 > 기타농수해양
• 파일형태: PDF
• 발행일자: 2020.12.30

국문 초록

본 연구는 SSR 마커를 이용하여 차나무에 대한 효율적인 품종 판별 체계를 확립하고 품종 간 유전적 관계를 바탕으로 교배육종의 기초자료로 활용하기 위하여 수행하였다. 국내 육성 10개 품종과 일본 품종 6개 및아샘 대엽 계통의 1개 등 총 17개 품종을 대상으로 차나무에서 다형성이 보고된 45개 SSR primer를 사용하여PCR을 수행하였다. 45개 SSR primer 중 PCR 증폭이 뚜렷하고 다형성이 분명하게 나타나는 23개를 선발하였다. PowerMarker V 3.25로 분석한 결과 유전자 수는 평균 2.5개, 유전자의 다양성은 평균 0.40, PIC 값은 평균 0.339, 유전적 거리는 0.11~0.59를 각각 나타내어 중간 수준의 다형성을 보였다. MEGA V 5.05로 유연관계를 분석한결과 품종들은 3개의 그룹으로 구분되었다. 그룹Ⅰ은 국내 품종 일부와 일본 품종이 포함되었으며 한국 품종과일본 품종 간 유전적 연관성이 높게 나타났다. 그룹Ⅱ는 유엽에서 붉은색을 나타내는 국내 품종과 Ai 37을 포함하고 있었다. 그룹Ⅲ은 제주에서 육성된 품종들로만 구성되었으며 다른 국내 육성 품종들과 기원 및 유래가 비슷하다고 알려진 것과는 차이가 있었다. SSR primer 45개로부터 선발된 23개 중 TM 068, MSG 0206, MSG 0699, KF 0643 등 단지 4개만을 사용하여 차나무 17개 품종을 모두 판별할 수 있었다. 본 연구 결과, 다양한 차나무의품종 판별에 이들 SSR primer들이 효율적으로 이용될 수 있음을 보여주었다.

영문 초록

This study was conducted to establish an efficient cultivar discrimination system for tea plants by using SSR markers for use as basic data for crossbreeding based on the genetic relationships between cultivars. PCR was performed using 45 SSR primers with polymorphisms reported in tea plants, for a total of 17 cultivars, including 10 domestic cultivars, six Japanese cultivars, and one Assam cultivar. From among the 45 SSR primers, 23 were selected based on distinct amplification and clear polymorphism. Mean values in the number of alleles, gene diversity, PIC value, and genetic distance (analyzed with PowerMarker V 3.25) were 2.5, 0.40, 0.339, and 0.11–0.59, respectively, which shows an intermediate level of polymorphism. As a result of analyzing the genetic relationships with MEGA V 5.05, the cultivars of tea plants were divided into three groups. Group I includes some domestic and Japanese cultivars, and there is a high genetic association between Korean and Japanese cultivars. Group II includes domestic cultivars showing red color in the leaves and Ai 37. Group III consists of only cultivars grown in Jeju, which deviates from the perception that all domestic cultivars have similar origins. Of the 23 SSR primers selected from the original 45, by using only four (TM 068, MSG 0206, MSG 0699, and KF 0643), all 17 cultivars of tea plants can be identified. This study shows that these SSR primers can be used effectively to identify the cultivars of various tea plants.

목차

서론

재료 및 방법

결과 및 고찰

참고문헌

키워드

품종판별 계통도 DNA 다형성 유전자 다양성 유연관계 cultivar discrimination dendrogram polymorphism gene diversity genetic relationship