학술논문
맥주보리의 large-InDel 마커 개발을 위한 whole genome re-sequencing의 이용
이용수 9
- 영문명
- Utilization of whole genome re-sequencing for large-InDel Markers Development in Malting Barley
- 발행기관
- 한국육종학회
- 저자명
- 김태헌(Tae-Heon Kim) 김양길(Yang-Kil Kim) 손재한(Jae-Han Son) 전재범(JaeBuhm Chun) 윤영미(Young-Mi Yoon)
- 간행물 정보
- 『한국육종학회지』Vol.53 No.3, 266~276쪽, 전체 11쪽
- 주제분류
- 농수해양 > 기타농수해양
- 파일형태
- 발행일자
- 2021.09.01
4,120원
구매일시로부터 72시간 이내에 다운로드 가능합니다.
이 학술논문 정보는 (주)교보문고와 각 발행기관 사이에 저작물 이용 계약이 체결된 것으로, 교보문고를 통해 제공되고 있습니다.
국문 초록
영문 초록
Barley is an economically important cereal crop grown under diverse environmental conditions and ranked fourth in terms of productionvolume. Barley is a diploid self-fertilizing plant with seven chromosomes, and has a 5.1 Gbp genome with more than 80% repeat sequences. Whole genome re-sequencing (WGR) has provided substantial information on sequence variation distributed on all chromosomes, such as singlenucleotide polymorphisms, insertions, and deletions, which are used in the development of DNA markers. In this study, we performed WGRto detect sequence variations among six Korean malting varieties. An average of 92,552 insertions and deletions (InDels) were detected inthese varieties in comparison to the high-quality reference genome sequences. The InDel density of the six Korean malting varieties rangedfrom 17 to 19 InDel/1Mbp with an average of 18 InDel/1Mbp. No InDel could be detected in 193 regions in all chromosomes except chr. unassigned. One interval with high-density InDel, more than 150 InDel/1Mbp, was located on the 1H, 3H, 6H, and 7H chromosomes. Atotal of 145 InDel markers were developed using 225 large-InDel markers, longer than 50 bp. Seventeen large-InDel makers showedpolymorphisms among 31 malting barley varieties. These 31 malting barley varieties were divided into four groups based on phylogeneticanalysis. These results presented a development method of agarose-resolvable large-InDel markers using WGR. Seventeen polymorphic large-InDelmarkers were used to conserve and identify barley germplasms. This vast information on sequence variation in six Korean malting barleyscould be used for the development of DNA markers and marker-assisted selection.
목차
서 언
재료 및 방법
결과 및 고찰
적 요
사 사
보충자료
REFERENCES
해당간행물 수록 논문
- 중만생 저아밀로스 가공용 벼 ‘미호 (밀양300호)’
- 대립 내탈립 녹색종피 유색콩 ‘청미인’
- 벼 단인자 계통과 우량 벼품종의 도열병 저항성 분석을 통한 안정 저항성 유전자 탐색
- 한국에서 수집한 재배형 들깨 계통들의 형태적 변이
- 세대단축을 위한 장일조건에서 트리티케일의 생육특성
- 생육기간이 짧고 수당립수가 많은 자포니카 조생 사료용 벼 ‘조농’
- 안토시아닌 함량이 많은 검정 찰성 쌀보리 ‘흑보찰’
- 한국형 밀 핵심집단의 유전적 다양성과 집단 구조 분석
- 여교잡을 통한 케나프 바이오매스 우수 계통 선발
- 맥주보리의 large-InDel 마커 개발을 위한 whole genome re-sequencing의 이용
- 향기가 있는 중소형 심비디움 ‘소담’ 육성
- 한국 콩(Glycine max (L.) Merr) 품종의 효율적인 원형질체 분리 및 유전자 도입
- 밀 육종소재 개발을 위한 식물 형질전환과 정밀육종 기술 현황
- 배추에서 Ribosomal DNAs 분포의 비교분자세포유전학적 분석
- 조숙, 다수성, 올레산 고함유 유채 1대잡종 ‘조안’
참고문헌
관련논문
농수해양 > 기타농수해양분야 BEST
더보기농수해양 > 기타농수해양분야 NEW
- 알코올로 유도된 간손상 모델 HepG2/2E1 세포에서 오리나무 잎 추출물의 간보호효과
- 차광처리가 제비붓꽃의 생장 및 생리적 특성에 미치는 영향
- 꼬리진달래 신초의 폴리페놀 프로파일링과 추출용매에 따른 유용성분 함량 및 항산화 활성 비교
최근 이용한 논문
교보eBook 첫 방문을 환영 합니다!
신규가입 혜택 지급이 완료 되었습니다.
바로 사용 가능한 교보e캐시 1,000원 (유효기간 7일)
지금 바로 교보eBook의 다양한 콘텐츠를 이용해 보세요!